Vitu Implementation Guide
0.2.3 - ci-build

Vitu Implementation Guide - Local Development build (v0.2.3) built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) Build Tools. See the Directory of published versions

Artifacts Summary

Contents:

This page provides a list of the FHIR artifacts defined as part of this implementation guide.

Patient Case Data

This chapter contains all profiles related to patient data like clinical information, observation, results or medical history for a case in VITU.

Cancer diagnosis

Profile of condition for a cancer diagnosis.
Discharge-Summary-Reference

Profile of DocumentReference for discharge summaries.
Episode Of care

Profile of EpisodeOfCare for a tumor disease.
MedicationStatement

Profile of MedicationStatement for a medication given to a patient.
Observation Disease Status

Profile on Observation for clinical status.
Observation-EBV

Profile on Observation for EBV Virus status.
Observation-ECOG

Profile to represent ECOG State
Observation-ERS

Profile on Observation for Estrogen Receptor (ER) status.
Observation-HER2

Profile on Observation for HER2 status
Observation-HPV

Profile on Observation for Human Papillovirus status.
Observation-Krankheitsverlauf

Profile on the course of disease.
Observation-PDL

Profile on Observation for PDL status.
Observation-PRS

Profile on Observation for PRS Virus status.
Observation-Subtype

Profile on Observation for cancer subtype.
Observation-UICC-TNM

Profil für UICC TNM Observation.
Patient

Profile on Patient.
Radiation procedure

Profile on Procedure for radiation therapy.
Surgery procedure

Profile on Procedure for surgeries.

Molecular gentic diagnostics

This chapter contains all profiles related to a diagnostic report for molecular sequencing.Those are special to molecular tumor boards.

Genetic Variant

Variant/Mutation of patient.
HRD Score

Homologous Recombination Deficiency
ImportantVariantList

Hält wichtige varianten fest.
Observation-MSI

Profile on Observation for microsatelite instability status.
Tumor Mutation Burden

Definitions for the tmb resource profile. The total number of mutations (changes) found in the DNA of cancer cells. Source: NCI Dictionary
VituReport

Therapy Recommendations

This chapter contains all profiles related to therapy recommendations.\nOnePatient has a therapy recommendation plan, which collects multiple recommendations. A recommendation can be explained by giving reasons.

Medication recommendation

A medication recommendation for a patient.
Therapy recommendation

One therapy recommendation for a tumor case.
Therapy recommendation plan

Profile for a collection of therapy recommendations prepared for and discussed in a MTB.
Therapy Recommendation Reason

Profile on Observation for Therapy Recommendation Reasons.

Therapy Recommendation Examples

This chapter contains all examples related to therapy recommendations.

Basic Therapy recommendation

Example recommendation for single medication.
Combination Therapy recommendation

Example therapy recommendation with a combination of multiple substances and protocols.
medication-request-abacavir

Ein beispielhaftes MedicationRequest für Abacavir
medication-request-flot

Ein beispielhaftes MedicationRequest für das Schema FLOT
Recommendation against

Example recommendation against a specific drug therapy.
Therapy recommendation plan example

This is an example for a therapy recommendation plan in VITU
Therapy recommendation reason against treatment

This is an example for a reasoned recommendation against a treatment
Therapy recommendation reason example

This is an example for a therapy recommendation reason. Multiple medicaments because of one gene.
Therapy recommendation reason example with multiple reasons

This is an example for a therapy recommendation reason. One medicament because of multiple reasons.
Trial recommendation

Example recommendation to participate in trial.

VITU workflow profiles

This This chapter contains all profiles related to the workflows in vitu.

Case Registration Composition

Profile on Composition. Acting as a collection of all involved resources.
List of important variants

Profile of List for important genomic variants.
Task

Profile of Task for the Vitu worklist.
Tumor Board Case Review

Profile of Encounter for a patient case review within molecular tumor boards.
VITUTumorboardCaseReview

Profile of DocumentReference for a case review document

Other VITU specific profiles

This This chapter contains all profiles related to the application vitu but do not reference a patient.

Medication

Profile of Medication.
Organization

Profile of Organization.
Practitioner

Profile on Practitioner.
PractitionerRole

Profile on PractitionerRole.
Tumor Board Conference

Profile of Encounter for molecular tumor board conferences.
VITU Conference

VITU non-TMB conference

Behavior: Operation Definitions

These are custom operations that can be supported by and/or invoked by systems conforming to this implementation guide.

Add Concept to Medication Operation

Adds a medication or treatment protocol to VITU
Get tumor-board recommendation document

Returns PDF based tumor-board recommendation documents for a specific organisation

Behavior: Search Parameters

These define the properties by which a RESTful server can be searched. They can also be used for sorting and including related resources.

EncounterDateStart

SearchParameter to search on Encounter.period.start
MolitEpisodeOfCareExtensionSP

SearchParameter to search on Resource.extension(http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/workflow-episodeOfCare)
TaskInput

EpisodeOfCare Reference on Task.input

Structures: Resource Profiles

These define constraints on FHIR resources for systems conforming to this implementation guide.

Data-Donation-Consent

This is the base profile for consents within VITU
Note-Reference

Profile of DocumentReference for freetext notes.
Other-Document-Reference

Profile of DocumentReference for other documents.
Pathology-Report-Reference

Profile of DocumentReference for pathological reports.
PotentielleTherapieOption

PotentielleTherapieOption
Related Publication Artifact

Holds information about publications relevant to a patients case.
VITUTumorboardEmpfehlung

Profile of DocumentReference for the treatment recommendations of TumorBoard.
VituSpecimen
VituTumorboardEmpfehlungPDFExport

Profile of DocumentReference for the treatment recommendations of TumorBoard.

Structures: Extension Definitions

These define constraints on FHIR data types for systems conforming to this implementation guide.

AssociatedReport
Evidence of recommendation Extension

Extension to document an evidence level and literature for a therapy recommendation.
Filename

Gives a filename to a binary resource
Literature as evidence

Extension to document literature as evidence for a therapy recommendation.
Medication recommendation

Reference to a related medication recommendation
Patientenfall in VITU
Priority of recommendation

A care plan collects multiple recommendations. Recommendations that should be selected first, get a higher priority (lower value).
ReasonCancelled
Recommendation Category

Extension which describes the category of a therapy recommendation.
Treatment context

Context in which a recommedation can be applied.
Tumor-Morphologie-Subtyp

Eine extension welche den morphologischen Subtypen des Krebs beschreibt.

Terminology: Value Sets

These define sets of codes used by systems conforming to this implementation guide.

Biomarkers

ValueSet for Biomarkers Observation.code in VITU including EBV, HPV, HER2, PDL1, ER, PR, MSI.
ConsentMolitDsVS

Dieses ValueSet enthält alle Consent Policies um die Datenspende inklusive Biomaterialspende abzubilden
DKTK Evidence Levels

This ValueSet contains all codes within the DKTK Evidence Level CodeSystem.
DNA Change Type

DNA Change Type of a variant.
ECOG

ECOG Performance Status (Level 0-5).
FunctionalClasseVS
Gesamtbeurteilung Tumor Status

Erlaubt die Beschreibung der Gesamtbeurteilung eines Tumorstatus.
High|Medium|Low
Identifier-Types

Codes indicating the type of action that is expected to be performed.
MSIAnswerCodes in VITU
MaterialTypenVS
Medications and Protocols with ATC Codes

A tumorboard can recommend subtances and protocols defined in this Value Set.
Note-Types

Note Types in VITU.
Recommendation category

Kategorien für Empfehlungen in VITU (z.B.: Leitlinie, Off-Label, Studie).
Recommendation-Status-Types

Status Types in VITU for recommendations.
Recommendation-Status-Types

Status Types in VITU for recommendations.
RequestGroupActionCodeVS
Simplified ValueSet for UICC Stage Codes

Dieses ValueSet enthält die vereinfachten UICC Staging Codes die zur Anmeldung am ZPM benutzt werden
SubstanceOrProtocolVS
TNM-M

Includes the following UICC codes for TNM-M.
TNM-N

Includes the following UICC codes for TNM-N.
TNM-T

Includes the following UICC codes for TNM-T.
TNM-Types

Beschreibt die Art des TNM: c für klinisch, p für pathologisch.
Therapy Recommendation Types
Therapy-point-in-time

Dieses ValueSet enthält die Codes für die Therapiezeitpunkte in Therapieempfehlungen in VITU.
Treatment context

Behandlungskontexte in VITU (nach ADTGEKID Datenseatz).
Tumorboard Abbruchgrund

ValueSet für den Grund des Abbruchs der Tumorboardteilnahme
Tumortype

Dieses ValueSet enthält entitätsspezifischen Tumorsubtypen zur Verwendung in VITU.
UICC cancer stage
VITU Organizations

VITU-Organizations
ValueSet der Therapiearten

Dieses ValueSet enthält Therapiearten zur Verwendung im Empfehlungsprotokoll von VITU.
ValueSet for HGNC Genes

Dieses ValueSet enthält alle HGNC GeneIDs.
ValueSet for PractitionerRole.speciality

This ValueSet includes all possible practitioner roles at a MTB.
ValueSet für Tumorarten

Ein ValueSet, das alle Tumorarten enthält.
VariantEffectVS
Vitu Workinglist ValueSet

ValueSet der möglichen VITU Arbeitslistenstatus

Terminology: Code Systems

These define new code systems used by systems conforming to this implementation guide.

CodeSystem Consent ZvPM

This CodeSystem represents the different consent modules a patient can consent to.
CodeSystem TNM Klassifizierung

Enthält alle Codes die in den einzelnen TNM Bestandteilen verwendet werden
Effekt der Variante
Materialtypen
SubstanceOrProtocol
Tags für VITU-Ressourcen
Tumorarten

Eine Liste verschiedener Tumorarten.
Tumorboard Abbruchgrund

Grund des Abbruchs der Tumorboardteilnahme
UICC-Stage-Klassifikation
VITU Arbeitslistenstatus CodeSystem

CodeSystem der möglichen VITU Arbeitslistenstatus
VITU-Evidence Levels

Levels of Evidence used in VITU
VITU-Gesamtbeurteilung Tumorstatus (nach ADTGEKID)

Codes zur Gesamtbeurteilung des Tumorstatus nach ADTGEKID.
VITU-Notizarten

Note Types used in VITU.
VITU-Organisationen

Enthält die Organisationen zur Benutzung in VITU.
VITUTask
Vitu Identifier Types

Vitu Identifier Types
VituCompositionDocumentType

Example: Example Instances

These are example instances that show what data produced and consumed by systems conforming with this implementation guide might look like.

Arzt

Ein Beispiel für den den behandelnden Arzt.
ArztRolle

Ein Beispiel für Arztrolle.
Arztbrief

Beispiel für einen Arztbrief im PDF Format
Arztbriefreferenz
Beispielpatient

Ein Beispiel für den Patient Max Mustermann.
Beispieltask

Bestandteil des Workflows, hält aufgaben fest.
CEGAT

Ein Beispiel für die Repräsentation der Organisation CEGAT, welche Laboruntersuchungen durchführt.
EBV

Beispielinstanz einer Observation welche den EBV Status festhält.
ECOG

Beispielinstanz einer Observation welche einen ECOG Wert enthält.
ERS

Beispielinstanz einer Observation welche den Estrogen-Receptor Status festhält.
Erkrankungszustand

Beispielinstanz einer Observation welche den aktuellen Ekrankungsstatus festhält.
ExportPdfBundle
Genetic Variant CNV, BRCA2

Shows an example resource for an genetic variant (CNV, BRCA2)
Genetic Variant SNV, EGFR

Shows an example resource for an genetic variant (SNV, EGFR)
HER2

Beispielinstanz einer Observation welche den HER2 Status festhält.
HPV

Beispielinstanz einer Observation welche den Status der HPV anzeigt.
HRDObservationExample

Beispielinstanz HRD.
Krankheitsverlauf

Beispielinstanz eines Krankheitsverlaufs.
Krebssubtyp

Beispielinstanz einer Subtyp-Observation.
MSI

Beispielinstanz einer Observation welche den Status der Mikrosatelliteninstabilität festhält.
MTB Anmeldeformular
Medikation

Ein Beispiel für die Repräsentation der Medikation eines Patienten.
MolecularReport
Notiz

Beispiel für eine Fallnotiz im txt Format
Notizreferenz
Operation

Ein Beispiel für eine Operation welche der Patient erhalten hat.
OtherKonferenz

Ein Beispiel für eine non-TMB Konferenz.
PDL

Beispielinstanz einer Observation welche den PDL Status festhält.
PRS

Beispielinstanz einer Observation welche den Progesterone Receptor Status festhält.
Pankreaskrebsdiagnose

Ein Beispiel für eine VITU Krebsdiagnose
Pathobefund

Beispiel für einen Pathologiebefund im PDF Format
Pathobefundreferenz
PotentielleTherapieOptionExample

PotentielleTherapieOptionExample
Publikationsreferenz
SLK

Ein Beispiel für die Repräsentation der Organisation SLK-Kliniken, welche Laboruntersuchungen durchführt.
SonstigesDokument

Beispiel für ein sonstiges Dokument
SonstigesDokumentreferenz
Strahlentherapie

Ein Beispiel für eine Strahlentherapie.
SystemischeTherapie

Ein Beispiel für die Repräsentation der Gabe von einem oder mehrerer Medikamente (hinterlegt durch Medication Resourcen).
TMBFall

Ein Beispiel für ein Encounter welcher einen MTB Fall innerhalb einer MTB Konferenz abbildet.
TMBKonferenz

Ein Beispiel für eine MTB Konferenz.
TMBObservationExample

Beispielinstanz TMB.
TempDokument

Beispiel für ein temporäres Dokument im PDF Format
Testpatient

Ein Beispiel für einen Testpatienten
TumorBoardEmpfehlung
Tumorerkrankung

Ein Beispiel für die Episode einer Tumorerkrankung.
UICCTNM

Enthält Wert für UICC Stadium sowie TNM-Komponente.
VITU Sample

VITU Sample: Tissue, Blood, etc.
VITUConsentDatenspende

Ein Beispiel für einen Consent zur Datenspende
VITUConsentDatenspendeV2

Ein Beispiel für einen Consent zur Datenspende mit Biomaterial
VituTumorboardEmpfehlungPDFExportExample
questionnaire-response-example
research-subject-example

Example ResearchSubject